Denne vejledning henvender sig til studerende og ansatte, der gerne vil have mere viden om søgning i databasen PubMed.
Udgiver
National Center for Biotechnology Information (NCBI), som er en del af U.S. National Library of Medicine (NLM) under National Institutes of Health (NIH).
Indhold
Mere end 40 mio. referencer til primært tidsskriftartikler fra 1946 og frem.
Medtager udover indhold i MEDLINE desuden alle artikler fra PubMed Central og e-bøger fra Bookshelf.
Dækning: Natur- og sundhedsvidenskab. International, men med hovedvægt på USA. Enkelte nordiske tidsskrifter.
Indeholder ikke fuld tekst, men linker til fuldtekst hos udgiver eller hos VIA Bibliotek.
Trunkering og kombinering
Trunkeringstegnet er *
De boolske operatorer AND OR NOT kan anvendes – operatorerne skrives med store bogstaver.
Adgang
Fri adgang. Benyt linket på VIA Biblioteks Webportal. Så får du ved hver reference hjælp til at hente den fulde tekst, hvis VIA har abonnement.
PubMed User guide: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/
PubMed Online Training: http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
Inspiration:
MeSH er Pubmeds kontrollerede emneord (medical subject headings).
Vær opmærksom på, at en søgning med MeSH termer ikke nødvendigvis medtager alle referencer, da nogle referencer ikke har fået tildelt MeSH termer.
Vælg MeSH Database fra PubMeds forside nederst:
Skriv dit søgeord ind, fx breast cancer og klik på Search > MeSH foreslår herefter relevante emneord
Klik ind på den ønskede term. Søg på termen ved at klikke på ”Add to search builder” og derefter ”Search PubMed”
Inden søgningen sendes afsted, er det muligt at afgrænse til et særligt aspekt af emnet, fx ”embryology”. Det er også muligt at afgrænse søgningen ved at vælge ”Restrict to MeSH Major Topic”. Det betyder, at termen skal være hovedemne i artiklen.
Fra PubMeds "Advanced Search" er der adgang til MeSH i bunden af skærmbilledet.
Der kan søges på enkeltord eller sammensatte begreber i den simple søgeformular.
Søgeordene vil blive søgt bredt i referencen, og PubMed vil desuden prøve at matche dine søgeord med en MeSH term samt eventuelle synonymer.
Fx vil en søgning på "breast cancer" også søge på "breast neoplasms", selvom du ikke har tastet denne term ind. Der søges også automatisk på underordnede termer til MeSH-termen.
Du kan tjekke, hvordan PubMed har udført din søgning ved at klikke på ”advanced” under søgefeltet.
Ved at klikke på den lille pil under ”details” i søgehistorikken, kan du få vist, hvordan PubMed har søgt på dine søgeord og vurdere, om søgningen passer til dit emne.
I nogle tilfælde medtager PubMed mange synonymer, så det er vigtigt, at du vurderer din søgning i ”details”.
Frasesøgning:
Ønsker du at søge på flere ord i præcis rækkefølge, kan du gøre det således:
Brug anførselstegn, fx ”fast track surgery”.
Brug bindestreg, fx fast-track-surgery.
Laver du en frasesøgning, vil PubMed ikke matche dine søgeord med MeSH-termer.
Trunkering:
Der kan trunkeres med * - det trunkerede ord skal bestå af mindst 4 karakterer.
Ved at trunkere et søgeord, fx feed*, finder du alle ord, der begynder med det indtastede ord.
Ved trunkering matcher PubMed ikke dit søgeord med MeSH-termer.
Søgning på ord i ental medtager automatisk flertalsformerne.
Boolske operatorer:
Taster du flere søgeord ind, kombineres de automatisk med ”AND”.
Vil du selv angive AND og OR, skal operatorene skrives med store bogstaver.
Du kan angive, at dit søgeord skal stå i et bestemt felt i artiklen, fx i titlen.
Det gøres lettest ved at anvende ”Advanced search”. Her finder du en drop-down boks, hvor du kan vælge, i hvilket felt søgeordet skal stå.
Du kan også konstruere en mere kompleks søgning ved hjælp af feltkoder - disse koder finder du i PubMed User Guide: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/ under "Using search field tags".
Det er muligt at angive, at dine søgeord skal stå tæt på hinanden i de referencer, søgningen finder - En søgning med såkaldte nærhedsoperatorer. Det er muligt, hvis du enten søger på ord i titlen [ti] eller titel/abstract [tiab]. Her skal feltkoderne for titel og titel/abstract anvendes.
Søgningen ”hip pain” [ti:~4] finder ordene hip og pain indenfor 4 ords afstand fra hinanden i titlen i tilfældig rækkefølge.
Søgningen ”hip pain” [tiab:~4] finder ordene hip og pain indenfor 4 ords afstand fra hinanden i titlen eller abstractet i tilfældig rækkefølge.
Skal søgeordene stå lige ved siden af hinanden i tilfældig rækkefølge, søges: ”søgeord1 søgeord2”:[feltkode:~0]
I søgninger med nærhedsoperator kan du ikke trunkere.
Visning af søgeresultatet
I søgeresultatet vises uddrag af referencen, hvor dine søgeord er fremhævet – det kan hjælpe dig til hurtigere at vurdere artiklens relevans.
Ved at klikke på "Display options" i øverste højre hjørne af skærmbilledet, kan du ændre visningen, så du ser hele artiklens abstract, samt ændre, hvor mange referencer, du vil have vist pr. side.
Sortering af søgeresultat
PubMed sorterer dit søgeresultat, så de mest relevante artikler vises på de første sider – også kaldet ”best match” – ud fra dine søgeord, sammenholdt med titel, abstract og MeSH-termer.
Vil du have sorteret søgeresultatet efter fx udgivelsesdato eller forfatter, skal du vælge den ønskede sortering fra drop-down menuen under "Sort By".
Navigation i søgeresultatet
Du kan klikke dig ind på en af artiklerne og bladre frem og tilbage i dit søgeresultat med pilene til venstre eller højre i bunden af skærmbilledet.
Afgræns søgeresultat ved hjælp af filtre
I venstre margen gives adgang til at filtrere dit søgesæt – fx på artikeltypen "Clinical Trial" eller på artikler publiceret de seneste 10 år.
Vil du fx også afgrænse på aldersgrupper eller andre parametre end de viste, skal du klikke på ”Additional filters” for at tilvælge yderligere afgrænsningsmuligheder.
Filtrene fastholdes i kommende søgninger, indtil du selv sletter dem igen ved at klikke på ”Clear applied filters” eller ”Reset filters menu”.
NB: vi anbefaler, at du først tilføjer filtre, når du er så langt med din søgning, at du har lagt dig fast på dine søgeord.
Login-knappen findes i øverste højre hjørne af skærmbilledet. Du kan vælge at logge ind med fx din Google- eller Microsoft-konto. Vælger du ”more login options” under de nævnte muligheder, kan du fremsøge VIA University College og logge ind med dit VIA-login.
Du kan gemme din søgning ved at klikke på ”Create alert” under søgeformularen. Dette forudsætter, at du er logget ind. Det er muligt at bruge fx sit VIA login, Facebook eller Google login.
Referencer, som du vil vende tilbage til, kan du vinge af og gemme som fil, e-maile eller sende til Clipboard (indkøbskurv) eller din konto på My NCBI.
OBS: Eksport til Zotero ved hjælp af Connector beskrives i VIA Biblioteks vejledning til Zotero.
Når du skal eksportere et større antal referencer eller et helt søgesæt (op til 10.000 referencer), gøres dette ved at klikke på "Send to": "Citation manager".
Herefter skal du bekræfte, hvilke referencer, du ønsker eksporteret:
- All results on this page: Poster fra den side, du befinder dig på
- All results: Alle poster i dit søgeresultat
- Selection: De markerede referencer
Klik på "Create file": Der dannes nu en .nbib fil, som du kan gemme på din computer og derefter importere i dit referenceværktøj. PubMed opererer ikke med RIS filer.
Når du vælger abstract-visningen i "display options", kan du under "Supplementary Info" se, hvilke MeSH emneord artiklen har fået tildelt - altså hvad artiklens emner er. Dette kan give inspiration til nye søgeord.
Hent også inspiration ved at kigge på ”Similar articles”, som du finder ved at klikke på "Proceed to details"under abstractet.
Ved nogle artikler får du angivet artiklens egne referencer samt hvilke andre artikler, der har citeret den viste artikel. Vær opmærksom på, at denne citationsvisning IKKE er lige så komplet som citationssøgning i databaserne Web of Science og Scopus.
Brug "Page Navigation" til at komme hurtigt til den del af referencen, du vil kigge på.
Klik på ”Advanced” under søgelinjen for at se din søgehistorie.
Klik på de tre prikker under "Actions" og vælg "Add Query" for at kombinere søgninger.
Husk at vælge den korrekte operator - AND eller OR.
Hvis du ser en rød advarsel ud for en søgning, skyldes det oftest, at du har søgt på et såkaldt ”stopord” i PubMed. Det er småord som fx in, the, an… som PubMed udelader i søgeregistrene, fordi de forekommer så hyppigt.
OBS: Søgningen er ikke fejlet, da PubMed søger på alle øvrige ord
I Abstract-formatet er der i bunden af hver resultatvisning ofte et ikon til fuld tekst hos forlaget, her fx hos forlaget Wiley. Dette link virker (i nogle tilfælde) fra Campus.
Virker linket ikke eller ønskes der fjernadgang til artiklen hjemmefra, benyttes altid ikonen ”VIA Library”.
Dette link tjekker adgang hos alle VIA’s leverandører og giver mulighed for at logge ind med dit VIA login.
Brug for mere hjælp? Kontakt Maria Breddam Slæggerup, [email protected].
Opdateret juli 2026